Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

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• GeneralizedIBMethod() : IBAMR::GeneralizedIBMethod
• GeneralOperator() : IBTK::GeneralOperator
• GeneralSolver() : IBTK::GeneralSolver
• generateASMSubdomains() : IBAMR::StaggeredStokesPETScLevelSolver, IBTK::CCPoissonPETScLevelSolver, IBTK::PETScLevelSolver, IBTK::SCPoissonPETScLevelSolver
• generateFieldSplitSubdomains() : IBAMR::StaggeredStokesPETScLevelSolver, IBTK::PETScLevelSolver
• getA() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getAbsoluteTolerance() : IBTK::GeneralSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getAdvDiffHierarchyIntegrator() : IBAMR::CFINSForcing
• getAdvectionVelocity() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator, IBAMR::ConvectiveOperator
• getAdvectionVelocityFunction() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getAdvectionVelocityIsDivergenceFree() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getAdvectionVelocityVariable() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getAllenCahnEquationConvectiveOperator() : IBAMR::AllenCahnHierarchyIntegrator
• getAO() : IBTK::LDataManager
• getArray() : IBTK::LData
• getASMSubdomains() : IBTK::PETScLevelSolver
• getAssignedCellIndex() : IBTK::IndexUtilities
• getBaseVector() : IBTK::JacobianOperator, IBTK::PETScMFFDJacobianOperator, IBTK::PETScSNESJacobianJOWrapper
• getBendingRigidities() : IBAMR::IBBeamForceSpec
• getBodyForceVariable() : IBAMR::IBHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getBrinkmanPenalization() : IBAMR::BrinkmanAdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getBrinkmanPenalizationStrategy() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getBufferStart() : IBTK::FixedSizedStream
• getCachedPatchDataIndex() : IBTK::SAMRAIDataCache
• getCalculateRotationalMomentum() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters
• getCalculateTranslationalMomentum() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters
• getCanonicalLagrangianIndex() : IBAMR::IBRedundantInitializer
• getCellCenter() : IBTK::IndexUtilities
• getCellIndex() : IBTK::IndexUtilities, IBTK::LSetDataIterator< T >
• getCellWeightPatchDescriptorIndex() : IBTK::HierarchyMathOps
• getCellWeightVariable() : IBTK::HierarchyMathOps
• getCIBMobilitySolver() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getCoarsenAlgorithm() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getCoarsenOpStencilWidth() : IBTK::CoarsenPatchStrategySet
• getCoarsenSchedules() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getCoarseSolver() : IBTK::VCSCViscousOpPointRelaxationFACOperator
• getCoarsestLevelNumber() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters, IBTK::SAMRAIDataCache
• getCommunicator() : IBTK::IBTK_MPI
• getComponentDatabase() : IBTK::AppInitializer
• getComponentVectors() : IBTK::SAMRAIScopedVectorDuplicate< TYPE >
• getCOMRotVelocity() : IBAMR::IBFEDirectForcingKinematics
• getCOMTransVelocity() : IBAMR::IBFEDirectForcingKinematics
• getConstraintForce() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::CIBStrategy
• getContext() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getConvectiveDifferencingType() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator, IBAMR::ConvectiveOperator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getConvectiveOperator() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator, IBAMR::INSCollocatedHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator, IBAMR::INSStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredConservativeHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getConvectiveOperatorInputDatabase() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getConvectiveOperatorType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getConvectiveTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getCreepingFlow() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getCurrentBodyCenterOfMass() : IBAMR::CIBStrategy
• getCurrentCFLNumber() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getCurrentCOMVelocity() : IBAMR::ConstraintIBMethod
• getCurrentContext() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getCurrentCycleNumber() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getCurrentIndex() : IBTK::FixedSizedStream
• getCurrentRigidBodyVelocity() : IBAMR::CIBStrategy
• getCurrentSize() : IBTK::FixedSizedStream
• getCurrentStructureCOM() : IBAMR::ConstraintIBMethod
• getCurrentTimeInterval() : IBAMR::BrinkmanAdvDiffBcHelper
• getCurrentTimeStepSize() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getDamping() : IBAMR::IBTargetPointForceSpec
• getDampingCoefficient() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDataItem() : IBTK::LSetDataIterator< T >
• getDataSet() : IBTK::LSet< T >
• getDataStreamSize() : IBAMR::IBAnchorPointSpec, IBAMR::IBBeamForceSpec, IBAMR::IBInstrumentationSpec, IBAMR::IBRodForceSpec, IBAMR::IBSourceSpec, IBAMR::IBSpringForceSpec, IBAMR::IBTargetPointForceSpec, IBTK::LNode, IBTK::LNodeIndex, IBTK::LSet< T >, IBTK::Streamable, IBTK::StreamableManager
• getDefaultConvectiveDifferencingType() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDefaultConvectiveOperatorInputDatabase() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getDefaultConvectiveOperatorType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getDefaultConvectiveTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getDefaultDiffusionTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDefaultInitialConvectiveTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator
• getDefaultInterpKernelFunction() : IBTK::LDataManager
• getDefaultInterpSpec() : IBAMR::IIMethod
• getDefaultSpreadKernelFunction() : IBTK::LDataManager
• getDefaultSpreadSpec() : IBAMR::IIMethod
• getDepth() : IBTK::LData
• getDestinationData() : IBTK::LTransaction< T >
• getDestinationProcessor() : IBTK::CopyToRootTransaction, IBTK::LTransaction< T >
• getDiffusionCoefficient() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDiffusionCoefficientFunction() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDiffusionCoefficientVariable() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDiffusionTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getDt() : IBTK::FACPreconditionerStrategy, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver
• getEdgeMap() : IBTK::ParallelEdgeMap
• getEndTime() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getEulerianElasticityLevelOp() : IBAMR::StaggeredStokesIBLevelRelaxationFACOperator
• getEulerianQPatchDataIndex() : IBAMR::IBInterpolantMethod
• getExodusIIFilename() : IBTK::AppInitializer
• getFaceWeightPatchDescriptorIndex() : IBTK::HierarchyMathOps
• getFaceWeightVariable() : IBTK::HierarchyMathOps
• getFACPreconditionerStrategy() : IBTK::FACPreconditioner
• getFEDataManager() : IBAMR::IIMethod
• getFinestLevelNumber() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters, IBTK::SAMRAIDataCache
• getFlowValues() : IBAMR::IBInstrumentPanel
• getFluidSourceVariable() : IBAMR::IBHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getFluxIntegralData() : IBAMR::AdvectorPredictorCorrectorHyperbolicPatchOps
• getForceData() : IBAMR::IBMethod
• getForceFunctionIndices() : IBAMR::IBSpringForceSpec
• getFreeRigidVelocities() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::CIBStrategy
• getFromDatabase() : IBTK::LSet< T >, IBTK::MarkerPatchHierarchy
• getFromInput() : IBAMR::IBRedundantInitializer, IBAMR::StokesWaveGeneratorStrategy
• getFunctionVector() : IBTK::NewtonKrylovSolver, IBTK::PETScNewtonKrylovSolver
• getGhostCellWidth() : IBTK::LDataManager
• getGhostedLocalFormArray() : IBTK::LData
• getGhostedLocalFormVecArray() : IBTK::LData
• getGhostfillRefineAlgorithm() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getGhostfillRefineSchedules() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getGhostGlobalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getGhostLagrangianIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getGhostLocalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getGhostNodeCount() : IBTK::LData
• getGhostNodes() : IBTK::LMesh
• getGhostPeriodicShifts() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getGlobalNodeCount() : IBTK::LData
• getGlobalNodeOffset() : IBTK::LDataManager
• getGlobalPETScIndex() : IBTK::LNodeIndex
• getGlobalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getGMVFilename() : IBTK::AppInitializer
• getGriddingAlgorithm() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getHelmholtzRHSOperator() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getHelmholtzSolver() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getHierarchyMathOps() : IBAMR::IBStrategy, IBAMR::STSMassFluxIntegrator, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver, IBTK::HierarchyIntegrator
• getHomogeneousBc() : IBTK::FACPreconditionerStrategy, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver, IBTK::RobinPhysBdryPatchStrategy
• getHydrodynamicForceObject() : IBAMR::IBHydrodynamicForceEvaluator
• getHyperbolicLevelIntegrator() : IBAMR::AdvDiffPredictorCorrectorHierarchyIntegrator
• getHyperbolicPatchStrategy() : IBAMR::AdvDiffPredictorCorrectorHierarchyIntegrator
• getIBFEMethodOps() : IBAMR::IBLevelSetMethod
• getIBGhosted() : IBTK::LibMeshSystemIBVectors
• getIBInstrumentPanel() : IBAMR::IBMethod
• getIBMethodOps() : IBAMR::IBLevelSetMethod
• getIBStrategy() : IBAMR::IBHierarchyIntegrator
• getInitialConditions() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getInitialConvectiveTimeSteppingType() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getInitialGuessNonzero() : IBTK::LinearSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getInitialPeriodicDisplacement() : IBTK::LNodeIndex
• getInitialPeriodicOffset() : IBTK::LNodeIndex
• getInputDatabase() : IBTK::AppInitializer
• getINSHierarchyIntegrator() : IBAMR::IBStrategy
• getInstrumentDataReadTime() : IBAMR::IBInstrumentPanel
• getInstrumentNames() : IBAMR::IBInstrumentationSpec, IBAMR::IBInstrumentPanel
• getIntegratorStep() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getIntegratorTime() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getInteriorGlobalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getInteriorLagrangianIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getInteriorLocalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getInteriorPeriodicShifts() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getIntermediateVelocityBoundaryConditions() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getInterpolatedLinearOperatorMuPatchDataIndex() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getInterpolatedVelocity() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::CIBStrategy
• getInterpScale() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getIsAllLagrangianDataInDomain() : IBAMR::IBRedundantInitializer, IBTK::LInitStrategy
• getIsInitialized() : IBTK::FACPreconditionerStrategy, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver
• getIsRegisteredWithStreamableManager() : IBAMR::IBAnchorPointSpec, IBAMR::IBBeamForceSpec, IBAMR::IBInstrumentationSpec, IBAMR::IBRodForceSpec, IBAMR::IBSourceSpec, IBAMR::IBSpringForceSpec, IBAMR::IBStandardSourceGen, IBAMR::IBTargetPointForceSpec
• getJacobian() : IBTK::NewtonKrylovSolver
• getKinematicsVelocity() : IBAMR::ConstraintIBKinematics
• getLagIdxRange() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters
• getLagrangeMultiplier() : IBAMR::ConstraintIBMethod
• getLagrangianIndex() : IBTK::LNodeIndex
• getLagrangianIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getLagrangianStructureID() : IBTK::LDataManager
• getLagrangianStructureIDs() : IBTK::LDataManager
• getLagrangianStructureIndexRange() : IBTK::LDataManager
• getLagrangianStructureIsActivated() : IBAMR::IBMethod, IBAMR::IBStrategy, IBTK::LDataManager
• getLagrangianStructureName() : IBTK::LDataManager
• getLagrangianStructureNames() : IBTK::LDataManager
• getLambda() : IBAMR::StokesSpecifications
• getLData() : IBTK::LDataManager
• getLDataManager() : IBAMR::IBInterpolantMethod, IBAMR::IBMethod
• getLECouplingPositionData() : IBAMR::IBMethod
• getLevelDt() : IBTK::StandardTagAndInitStrategySet
• getLevelHasLagrangianData() : IBAMR::IBRedundantInitializer, IBTK::LInitStrategy
• getLevelSAMRAIVectorReal() : IBTK::FACPreconditionerStrategy
• getLinearizedForceData() : IBAMR::IBMethod
• getLinearizedPositionData() : IBAMR::IBMethod
• getLinearizedVelocityData() : IBAMR::IBMethod
• getLinearOperatorMuPatchDataIndex() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getLinearOperatorRhoPatchDataIndex() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getLinearSolver() : IBTK::NewtonKrylovSolver
• getLiquidFractionPhysicalBcCoef() : IBAMR::AllenCahnHierarchyIntegrator
• getLMesh() : IBTK::LDataManager
• getLNodePatchDescriptorIndex() : IBTK::LDataManager
• getLocalFormArray() : IBTK::LData
• getLocalFormVecArray() : IBTK::LData
• getLocalNodeCount() : IBTK::LData
• getLocalNodes() : IBTK::LMesh
• getLocalPETScIndex() : IBTK::LNodeIndex
• getLocalPETScIndices() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getLoggingEnabled() : IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver
• getLSiloDataWriter() : IBTK::AppInitializer
• getManager() : IBAMR::AdvDiffConvectiveOperatorManager, IBAMR::INSCollocatedConvectiveOperatorManager, IBAMR::INSStaggeredConvectiveOperatorManager, IBAMR::StaggeredStokesSolverManager, IBTK::CCPoissonSolverManager, IBTK::KrylovLinearSolverManager, IBTK::LDataManager, IBTK::NewtonKrylovSolverManager, IBTK::SCPoissonSolverManager, IBTK::StreamableManager
• getMap() : IBTK::ParallelMap
• getMarkerPatch() : IBTK::MarkerPatchHierarchy
• getMassDensityVariable() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getMasterNodeIndex() : IBAMR::IBBeamForceSpec, IBAMR::IBInstrumentationSpec, IBAMR::IBRodForceSpec, IBAMR::IBSourceSpec, IBAMR::IBSpringForceSpec, IBAMR::IBTargetPointForceSpec
• getMaterialParams() : IBAMR::IBRodForceSpec
• getMaxEvaluations() : IBTK::NewtonKrylovSolver
• getMaximumTimeStepSize() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getMaximumTimeStepSizeSpecialized() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator, IBAMR::AdvDiffPredictorCorrectorHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator, IBTK::HierarchyIntegrator
• getMaximumVorticityMagnitude() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getMaxIntegratorSteps() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getMaxIterations() : IBTK::GeneralSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getMaxPointDisplacement() : IBAMR::IBStrategy, IBAMR::IBStrategySet
• getMeanPressureValues() : IBAMR::IBInstrumentPanel
• getMeshDependentCurvatures() : IBAMR::IBBeamForceSpec
• getMeterIndex() : IBAMR::IBInstrumentationSpec
• getMGCycleType() : IBTK::FACPreconditioner
• getMinimumGhostCellWidth() : IBAMR::IBInterpolantMethod, IBAMR::IBLevelSetMethod, IBAMR::IBMethod, IBAMR::IBStrategy, IBAMR::IBStrategySet, IBAMR::IIMethod
• getMinimumGhostWidth() : IBAMR::SurfaceTensionForceFunction, IBTK::LEInteractor
• getMinimumTimeStepSize() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getMinimumTimeStepSizeSpecialized() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getMobilitySolvers() : IBAMR::CIBMobilitySolver
• getMu() : IBAMR::StokesSpecifications
• getName() : IBAMR::AdvectorExplicitPredictorPatchOps, IBAMR::AdvectorPredictorCorrectorHyperbolicPatchOps, IBAMR::BrinkmanAdvDiffBcHelper, IBTK::FACPreconditionerStrategy, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver, IBTK::HierarchyIntegrator, IBTK::LData
• getNeighborNodeIndices() : IBAMR::IBBeamForceSpec
• getNetExternalForceTorque() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::CIBStrategy
• getNetRigidGeneralizedForce() : IBAMR::CIBStrategy
• getNewBodyCenterOfMass() : IBAMR::CIBStrategy
• getNewContext() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getNewRigidBodyVelocity() : IBAMR::CIBStrategy
• getNextNodeIndices() : IBAMR::IBRodForceSpec
• getNodeCountPatchDescriptorIndex() : IBTK::LDataManager
• getNodeData() : IBTK::LNode
• getNodeDataItem() : IBTK::LNode
• getNodeDataVector() : IBTK::LNode
• getNodeIndex() : IBAMR::IBAnchorPointSpec, IBAMR::IBInstrumentationSpec
• getNodes() : IBTK::IBTK_MPI
• getNormalizeSpreadForce() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getNullspaceBasisVectors() : IBTK::LinearSolver
• getNullspaceContainsConstantVector() : IBTK::LinearSolver
• getNumberCellGhosts() : IBAMR::AdvectorExplicitPredictorPatchOps
• getNumberFluxGhosts() : IBAMR::AdvectorExplicitPredictorPatchOps
• getNumberOfBeams() : IBAMR::IBBeamForceSpec
• getNumberOfCycles() : IBAMR::AdvDiffSemiImplicitHierarchyIntegrator, IBAMR::IBImplicitStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredConservativeHierarchyIntegrator, IBTK::HierarchyIntegrator
• getNumberOfGhostNodes() : IBTK::LDataManager
• getNumberOfInterfaceCells() : IBAMR::SurfaceTensionForceFunction
• getNumberOfLocalNodes() : IBTK::LDataManager
• getNumberOfMarkers() : IBAMR::IBExplicitHierarchyIntegrator, IBTK::MarkerPatchHierarchy
• getNumberOfNodes() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::CIBStrategy, IBAMR::IBInterpolantMethod, IBTK::LDataManager
• getNumberOfRigidStructures() : IBAMR::CIBStrategy
• getNumberOfRods() : IBAMR::IBRodForceSpec
• getNumberOfSprings() : IBAMR::IBSpringForceSpec
• getNumIterations() : IBTK::BGaussSeidelPreconditioner, IBTK::BJacobiPreconditioner, IBTK::GeneralSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getNumLinearIterations() : IBTK::NewtonKrylovSolver
• getNumPostSmoothingSweeps() : IBTK::FACPreconditioner
• getNumPreSmoothingSweeps() : IBTK::FACPreconditioner
• getNumSnapshots() : IBTK::SnapshotCache
• getNumSources() : IBAMR::IBLagrangianSourceStrategy, IBAMR::IBStandardSourceGen
• getOldVelocityVariable() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getOperator() : IBTK::KrylovLinearSolver, IBTK::NewtonKrylovSolver
• getOperatorName() : IBTK::CartCellDoubleBoundsPreservingConservativeLinearRefine, IBTK::CartCellDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartCellDoubleQuadraticRefine, IBTK::CartSideDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Coarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Refine, IBTK::CartSideDoubleSpecializedLinearRefine
• getOperatorPriority() : IBTK::CartCellDoubleBoundsPreservingConservativeLinearRefine, IBTK::CartCellDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartCellDoubleQuadraticRefine, IBTK::CartSideDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Coarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Refine, IBTK::CartSideDoubleSpecializedLinearRefine
• getParameters() : IBAMR::IBSpringForceSpec
• getPatchHierarchy() : IBTK::HierarchyIntegrator, IBTK::HierarchyMathOps, IBTK::LDataManager
• getPatchIndex() : IBTK::SnapshotCache
• getPatchLevels() : IBTK::LDataManager
• getPatchVertices() : IBAMR::IBRedundantInitializer
• getPatchVerticesAtLevel() : IBAMR::IBRedundantInitializer
• getPatternName() : IBTK::CellNoCornersFillPattern, IBTK::EdgeSynchCopyFillPattern, IBTK::FaceSynchCopyFillPattern, IBTK::NodeSynchCopyFillPattern, IBTK::SideNoCornersFillPattern, IBTK::SideSynchCopyFillPattern
• getPeriodicDisplacement() : IBTK::LNodeIndex
• getPeriodicOffset() : IBTK::LNodeIndex, IBTK::LSet< T >
• getPeriodicShifts() : IBTK::LIndexSetData< T >
• getPETScKSP() : IBAMR::KrylovFreeBodyMobilitySolver, IBAMR::KrylovMobilitySolver, IBTK::PETScKrylovLinearSolver, IBTK::PETScLevelSolver
• getPETScMat() : IBTK::PETScMatLOWrapper
• getPETScPC() : IBTK::PETScPCLSWrapper
• getPETScSNES() : IBTK::PETScNewtonKrylovSolver, IBTK::PETScSNESFunctionGOWrapper, IBTK::PETScSNESJacobianJOWrapper
• getPETScSNESFunctionContext() : IBTK::PETScSNESFunctionGOWrapper
• getPETScSNESJacobianContext() : IBTK::PETScSNESJacobianJOWrapper
• getPhysicalBcCoefs() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator, IBTK::LaplaceOperator
• getPhysicalBoundaryCodim1Boxes() : IBTK::PhysicalBoundaryUtilities
• getPhysicalBoundaryCodim2Boxes() : IBTK::PhysicalBoundaryUtilities
• getPhysicalBoundaryCodim3Boxes() : IBTK::PhysicalBoundaryUtilities
• getPlotContext() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getPointwisePressureValues() : IBAMR::IBInstrumentPanel
• getPoissonSpecifications() : IBTK::LaplaceOperator
• getPositionData() : IBAMR::IBInterpolantMethod, IBAMR::IBMethod
• getPositionUpdateMethod() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters
• getPostProcessingDataDumpDirectory() : IBTK::AppInitializer
• getPostProcessingDataDumpInterval() : IBTK::AppInitializer
• getPreconditioner() : IBTK::KrylovLinearSolver
• getPressureBoundaryConditions() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getPressureHierarchyDataOps() : IBAMR::IBStrategy
• getPressureSubdomainSolver() : IBAMR::INSCollocatedHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator, IBAMR::INSStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getPressureVariable() : IBAMR::IBHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getPrimaryHierarchy() : IBTK::SecondaryHierarchy
• getProjectionBoundaryConditions() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getProlongationOp() : IBAMR::StaggeredStokesIBLevelRelaxationFACOperator
• getProlongRefineAlgorithm() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getProlongRefineSchedules() : IBAMR::IBStrategy, IBTK::HierarchyIntegrator
• getPrototypeStructIDs() : IBAMR::DirectMobilitySolver
• getQData() : IBAMR::IBInterpolantMethod
• getQIntegralData() : IBAMR::AdvectorPredictorCorrectorHyperbolicPatchOps
• getRank() : IBTK::IBTK_MPI
• getRefineOpStencilWidth() : IBTK::CartCellDoubleLinearCFInterpolation, IBTK::CartCellDoubleQuadraticCFInterpolation, IBTK::CartCellRobinPhysBdryOp, IBTK::CartExtrapPhysBdryOp, IBTK::CartSideDoubleDivPreservingRefine, IBTK::CartSideDoubleQuadraticCFInterpolation, IBTK::CartSideRobinPhysBdryOp, IBTK::CoarseFineBoundaryRefinePatchStrategy, IBTK::RefinePatchStrategySet
• getRegularizationWeight() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getRelativeTolerance() : IBTK::GeneralSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getResetFunctions() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getResetPriority() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getResidualNorm() : IBTK::BGaussSeidelPreconditioner, IBTK::BJacobiPreconditioner, IBTK::GeneralSolver, IBTK::PETScPCLSWrapper
• getRestartDatabase() : IBTK::AppInitializer
• getRestartDumpDirectory() : IBTK::AppInitializer
• getRestartDumpInterval() : IBTK::AppInitializer
• getRestartReadDirectory() : IBTK::AppInitializer
• getRestartRestoreNumber() : IBTK::AppInitializer
• getRestrictionScalingOp() : IBAMR::StaggeredStokesIBLevelRelaxationFACOperator
• getRho() : IBAMR::StokesSpecifications
• getRootPatchData() : IBTK::CopyToRootSchedule, IBTK::CopyToRootTransaction
• getSaddlePointSolver() : IBAMR::CIBStaggeredStokesSolver
• getSAMRAIDataCache() : IBTK::SecondaryHierarchy
• getSAMRAIVector() : IBTK::PETScSAMRAIVectorReal
• getSAMRAIVectorRead() : IBTK::PETScSAMRAIVectorReal
• getSAMRAIWorld() : IBTK::IBTK_MPI
• getScalingFactor() : IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getScratchContext() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getSecondaryHierarchy() : IBTK::SecondaryHierarchy
• getSet() : IBTK::ParallelSet
• getShape() : IBAMR::ConstraintIBKinematics
• getShiftedVertexPosn() : IBAMR::IBRedundantInitializer
• getSideCenter() : IBTK::IndexUtilities
• getSideWeightPatchDescriptorIndex() : IBTK::HierarchyMathOps
• getSideWeightVariable() : IBTK::HierarchyMathOps
• getSizeOfMemory() : IBTK::LIndexSetDataFactory< T >, IBTK::LSetDataFactory< T >
• getSlaveNodeIndices() : IBAMR::IBSpringForceSpec
• getSmoother() : IBAMR::SurfaceTensionForceFunction
• getSnapshot() : IBTK::SnapshotCache
• getSnapshotCache() : IBTK::HierarchyAveragedDataManager
• getSnapshotTimePoints() : IBTK::HierarchyAveragedDataManager
• getSolutionTime() : IBTK::FACPreconditionerStrategy, IBTK::GeneralOperator, IBTK::GeneralSolver
• getSolutionTolerance() : IBTK::NewtonKrylovSolver
• getSolutionVector() : IBTK::NewtonKrylovSolver, IBTK::PETScNewtonKrylovSolver
• getSolveRigidBodyVelocity() : IBAMR::CIBStrategy
• getSourceData() : IBTK::LTransaction< T >
• getSourceIndex() : IBAMR::IBSourceSpec
• getSourceLocations() : IBAMR::IBLagrangianSourceStrategy, IBAMR::IBStandardSourceGen
• getSourceNames() : IBAMR::IBStandardSourceGen
• getSourcePressures() : IBAMR::IBStandardSourceGen
• getSourceProcessor() : IBTK::CopyToRootTransaction, IBTK::LTransaction< T >
• getSourceRadii() : IBAMR::IBStandardSourceGen
• getSourceStrengths() : IBAMR::IBStandardSourceGen
• getSourceTerm() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getSourceTermFunction() : IBAMR::AdvDiffHierarchyIntegrator
• getSpreadScale() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver
• getStableTimestep() : IBAMR::INSCollocatedHierarchyIntegrator, IBAMR::INSHierarchyIntegrator, IBAMR::INSStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator
• getStaggeredStokesPETScLevelSolver() : IBAMR::StaggeredStokesIBLevelRelaxationFACOperator
• getStartTime() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getStencilSize() : IBTK::LEInteractor
• getStencilWidth() : IBTK::CartCellDoubleBoundsPreservingConservativeLinearRefine, IBTK::CartCellDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartCellDoubleQuadraticRefine, IBTK::CartSideDoubleCubicCoarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Coarsen, IBTK::CartSideDoubleRT0Refine, IBTK::CartSideDoubleSpecializedLinearRefine, IBTK::CellNoCornersFillPattern, IBTK::EdgeSynchCopyFillPattern, IBTK::FaceSynchCopyFillPattern, IBTK::NodeSynchCopyFillPattern, IBTK::SideNoCornersFillPattern, IBTK::SideSynchCopyFillPattern
• getStiffness() : IBAMR::IBTargetPointForceSpec
• getStokesSolver() : IBAMR::CIBSaddlePointSolver, IBAMR::INSStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::INSVCStaggeredHierarchyIntegrator, IBAMR::KrylovMobilitySolver
• getStokesSpecifications() : IBAMR::INSHierarchyIntegrator
• getStreamableClassID() : IBAMR::IBAnchorPointSpec, IBAMR::IBBeamForceSpec, IBAMR::IBInstrumentationSpec, IBAMR::IBRodForceSpec, IBAMR::IBSourceSpec, IBAMR::IBSpringForceSpec, IBAMR::IBTargetPointForceSpec, IBTK::Streamable, IBTK::StreamableFactory
• getStructIDs() : IBAMR::DirectMobilitySolver
• getStructureCOM() : IBAMR::IBFEDirectForcingKinematics
• getStructureHandle() : IBAMR::CIBMethod, IBAMR::IBInterpolantMethod
• getStructureIsSelfRotating() : IBAMR::ConstraintIBKinematics::StructureParameters
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• getSurfaceElevation() : IBAMR::FifthOrderStokesWaveGenerator, IBAMR::FirstOrderStokesWaveGenerator, IBAMR::IrregularWaveGenerator, IBAMR::StokesWaveGeneratorStrategy
• getSurfaceForceIntegral() : IBAMR::IIMethod
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• getTimePoint() : IBTK::HierarchyAveragedDataManager
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• getUnregisteredID() : IBTK::StreamableManager
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• getVariableIdx() : IBAMR::CFINSForcing
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• getWorkloadDataIndex() : IBTK::HierarchyIntegrator
• getWorkloadPatchDescriptorIndex() : IBTK::LDataManager
• grad() : IBTK::HierarchyMathOps, IBTK::PatchMathOps